ניתן להשתמש במגנטים במרכיבים מרכזיים רבים של הטכנולוגיה הרפואית, כאשר המפורסם שבהם הוא טכנולוגיית הדמיית תהודה מגנטית, אשר פותחה ויושמה בשנות ה-70 וה-80.
כמובן, בנוסף לכך, עדיין ניתן למצוא מגנטים במכשירים רפואיים רבים, שאנשים רבים אולי לא מכירים.
מתגים מגנטיים, מפרידי דם, מערכות סינון מים בבתי חולים, בדיקות מעבדה, מאווררים, משאבות אינסולין וציוד אחר יכולים כולם להשתמש במגנטים קבועים. השימוש במגנטים ברפואה משפר את הטיפול בחולים ומסייע רבות לצוות הרפואי בביצוע עבודת הצלת חיים חשובה.
ניתן למצוא מגנטים בכל קומה בבית חולים כדי לסייע בטיפול בחולים, ובנוסף להנעת מאווררים, מגנטים קבועים משמשים להנעת ציוד כגון משאבות לב.
הפעלת מיסבים מגנטיים על משאבות לב משפרת את אמינות המשאבה, מאריכה את חיי השירות שלה וממזערת נזקי דם.
במחלקות כירורגיות בבתי חולים מתפתחות טכנולוגיות חדשות המשתמשות במגנטים כדי לייעל ולפשט הליכים כירורגיים, כגון יצירת אנסטומוזות. באנסטומוזה של דחיסה מגנטית, מגנט מיוחד של אדמה נדירה ממוקם כדי לדחוס קטע של רקמה ליצירת אנסטומוזה. טכנולוגיה רפואית ניסיונית זו יוצרת אלטרנטיבה רצויה ביותר לשיטות מסורתיות, כלומר שימוש בתפירה ידנית או מהדקים, ונמצא שהיא דרך מהירה יותר להשלמת הליכים, וכתוצאה מכך החלמה מהנה יותר של המטופל. ביישומים רפואיים כלליים, מגנטים משמשים גם במערכות שמירה ובמערכות משאבות וסינון רבות ושונות.
מגנטים משמשים גם בטכנולוגיה המשפרת את חיי היומיום של אנשים עם תנאים מסוימים. עבור אנשים חירשים הבוחרים להשתמש בשתל שבלול, משתמשים במגנטים כדי להחזיק את ראש השבלול במקומו, כך שניתן יהיה להעביר קול ביעילות לשבלול הפנימי. מגנטים משמשים גם ברפואת שיניים ליישומים כגון סיוע בשמירה של שיניים תותבות. עבור אנשים המשתמשים בגפיים תותבות, מערכות מתלה גפיים תותבות מגנטיות עוזרות לשמור על מיקום הגפה התותבת תוך שיפור הנוחות הכללית והפחתת הצורך בתחזוקת גפיים תותבות.
