התהליך מורכב יותר, צריך להסתמך על מים כמדיום לבחירה. ציוד הפרדה מגנטי רטוב נפוץ כולל: ציוד הפרדה מגנטי רטוב בעוצמה נמוכה (מיכל הפחתת מים מגנטי, מפריד מגנטי מסוג גליל מגנט קבוע), ציוד הפרדה מגנטי רטוב (מפריד מגנטי מסוג גליל אינדוקציה רטוב, מפריד מגנטי מסוג Jones, מפריד מגנטי טבעת שטוחה). על פי מבנה הטנק ניתן לחלק למפריד מגנטי רטוב במורד הזרם, זרם נגדי וחצי זרם נגדי סוג שלוש.
מפריד מגנטי רטוב חוסך באנרגיה ומפחית את הצריכה, יכול לנצל ביעילות עפרות ברזל רזה במיוחד ולשפר את איכות תרכיז הברזל הסופי. משמש בדרך כלל לבחירת אבקת ברזל ואבקת ברזל חזקה מגנטית חזקה וחלשה. שני מפרידים מגנטיים רטובים הנפוצים בשימוש הם מפרידים מגנטיים בזרימה מטה ומפרידים מגנטיים חצי זרם נגדי.
מפריד מגנטי בזרימה מטה מתייחס לכיוון תנועת העיסה ולכיוון תנועת הצילינדר או תנועת המוצר. עיסת תיבת ההזנה ישירות לתוך המערכת המגנטית של הצילינדר למטה, חלקיקים חלשים לא מגנטיים ומגנטיים שנפלטו מהמרווח שמתחת לגליל, חלקיקים מגנטיים נשאבים על פני הגליל, כשהגליל מסתובב עד קצה השדה המגנטי הוא חלש, על ידי צינור המים הפריקה למיכל התרכיז. למפריד המגנטי במורד הזרם יש יכולת עיבוד גדולה וניתן להשתמש בו בסדרה. הוא מתאים לעיבוד חיספוס ולבחירה של עפרות מגנטיות גסות חזקות עם גודל חלקיקים 0~6 מ"מ וניתן להשתמש בה גם לשחזור מדיה כבדה מגנטית.
למפריד מגנטי חצי זרם נגדי יש איכות תרכיז גבוהה יותר ושחזור מתכות. הסילוף תלוי בצורה רופפת לתוך חלל המיון שמתחת לגוף המיכל, וכיוון תנועת הסילוף זהה בעצם לזה של הכוח המגנטי. לכן, חלקיקי העפרה יכולים להגיע אל פני השטח של הגליל בכוח מגנטי גבוה, והזנב נפלט מחור הזנב בצלחת התחתונה, כך שגובה פני הגלישה יכול לשמור על רמת התרחיץ בגוף המיכל. מפריד מגנטי חצי זרם נגדי נמצא בשימוש נרחב להתמודדות עם חלקיקים עדינים (פחות מ-0.2 מ"מ) של פעולת חיספוס מגנטי מגנטי חזק ותפעול בחירה, ניתן להשתמש בשילוב עם יותר, לשפר את דרגת התרכז.
הבחירה במפריד מגנטי היא שיקול מקיף של הבעיה, רוצה לדעת באיזה סוג של מפריד מגנטי כדאי להשתמש, או צריך לעבור סדרה של תהליכים כמו בדיקת הטבה או התייעצות עם יצרנים מנוסים מקצועיים, לפי המצב הספציפי של מוקשים שונים.
